Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2C1P98194 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2C1P98194 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms