Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HTRA4P83105 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTRA4P83105 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms