Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms