Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSBP53539 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSBP53539 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms