Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms