Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP11P51784 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP11P51784 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP11P51784 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP11P51784 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP11P51784 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP11P51784 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms