Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH9A1P49189 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms