Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms