Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD4P46934 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms