Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms