Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACADSBP45954 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms