Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRATP43155 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRATP43155 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRATP43155 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRATP43155 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms