Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGP37231 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms