Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNB1P35222 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms