Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKBRP32239 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms