Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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