Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP1P29466 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CASP1P29466 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP1P29466 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP1P29466 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP1P29466 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms