Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms