Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTX3P26022 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTX3P26022 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTX3P26022 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms