Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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