Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NME1P15531 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME1P15531 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME1P15531 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME1P15531 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME1P15531 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME1P15531 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME1P15531 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME1P15531 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms