Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX4I1P13073 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX4I1P13073 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms