Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms