Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DQB1P01920 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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