Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPAN13O95857 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPAN13O95857 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms