Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1O95273 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms