Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFL1O94874 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFL1O94874 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFL1O94874 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFL1O94874 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms