Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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