Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B4DGG1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B4DGG1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B4DGG1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B4DGG1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms