Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms