Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms