Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VWA3AA6NCI4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms