Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS37CA5D8V6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms