Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TARSL2A2RTX5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TARSL2A2RTX5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms