Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL370P-201ENST00000470869 295 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010608.1-201ENST00000507964 275 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM1-203ENST00000537011 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF41-201ENST00000313116 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF549-202ENST00000376233 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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KRTAP9-9Q9BYP9 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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KRTAP9-9Q9BYP9 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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KRTAP9-9Q9BYP9 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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KRTAP9-9Q9BYP9 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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