Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3BQ9Y3B1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms