Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms