Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms