Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms