Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN3Q9UKS6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms