Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNL1Q9UK58 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNL1Q9UK58 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms