Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms