Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLIP2Q9UDT6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms