Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms