Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSFQ9UBX1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms