Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM8A1Q9UBU6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM8A1Q9UBU6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms