Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKD2L1Q9P0L9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKD2L1Q9P0L9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKD2L1Q9P0L9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKD2L1Q9P0L9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKD2L1Q9P0L9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms