Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGPEP1Q9NXJ5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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