Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3GQ9NS98 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3GQ9NS98 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms