Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms